Hiện toàn huyện Phú Tân có tổng chiều dài 348,099km đường gồm Đường quốc lộ, đường tỉnh, đường huyện, đường đô thị và đường giao thông nông thôn và có 109 cầu. Về đường thủy, có 04 sông lớn do Trung ương quản lý, gồm: Sông Tiền, sông Hậu, sông Cái Vừng, sông Vàm Nao; có 19 tuyến kênh trục chính liên xã dài 105,8km do UBND huyện quản lý.

Từ năm 2021đến cuối 2024, huyện đã xã hội hóa đầu tư xây dựng được 11 cầu bê-tông, với tổng vốn đầu tư hơn 21 tỷ đồng, trong đó vốn xã hội hóa trên 19,3 tỷ đồng. Chương trình mục tiêu quốc gia xây dựng nông thôn mới, Phú Tân đã đầu tư nâng cấp láng nhựa, bê-tông 42 công trình, chiều dài 70km.

Theo kế hoạch xã hội hóa đầu tư xây dựng cầu giao thông nông thôn (GTNT) trên địa bàn huyện Phú Tân giai đoạn năm 2025 - 2030, huyện Phú Tân xây dựng tổng số 26 cây cầu trên các tuyến đường kênh Thần Nông và tuyến đường liên huyện, liên xã để thay thế một số cầu GTNT hiện đang bị xuống cấp, không còn đảm bảo an toàn giao thông, hoặc không đáp ứng được nhu cầu lưu thông cho các loại phương tiện phục vụ sản xuất - kinh doanh.
Qua đó, giúp hệ thống kết cấu hạ tầng GTNT của huyện cù lao ngày một phát triển đồng bộ, bền vững và đạt tiêu chuẩn kỹ thuật, hạ tầng giao thông tạo điều kiện thuận lợi để khuyến khích các doanh nghiệp và nhà đầu tư gia tăng sản xuất - kinh doanh vào khu vực nông thôn…